概要

テスト時や、開発中のプログラムの実行が手動で８ステップとかあるときに、どうやって自動化するかの方法について

結論

うまくいくケースのみ考えて、スクリプトにしてしまう。

3ステップにするとこんなかんじ

ステップ1、全体を実行するスクリプトをつくってしまう。

以下のようなbashスクリプトを用意する
今回は ./testscript.shとする

set -euxをつけておく。

• eエラーがおきたら止まるようにする
• u未定義変数があったら止まるようにする
• x実行したコマンドを出力する

#!/bin/bashset-euecho"Step 1 start"date# 実行したいコマンド、今は手で入力しているもの# cwltool step1.cwl# nextflow step1.nfecho"Step 1 end"date# n step分echo"ALL STEP IS OK!!"

ステップ2、定期的に実行するようにする

次に自分のcronの設定をし、
定期的に正しく実行できることを確認する。

実行されるディレクトリへ、明示的に cdしておく。

ログの回収するファイル名を、日付と時間にしておくと、
テストが失敗したときに、以前の結果と比べられるので、よかった。

ステップ3、通知をするようにする。

うまくいったか、いかなかったかを、Slack へ通知する
通知は、毎日おこなったほうがよいと考えている
成功だけとか、失敗だけとかにしておくと、通知システムの故障時など、通知がこないこと自体にきづかない。

• ./testscript.shが、自動実行スクリプト本体
• ./notify.shは、Slackへ通知をするスクリプトとする。
  • この部分は、 curlなどで直接実行しても良い。

#!/bin/bashRET=./testscript.sh
if[${RET}-ne 0 ];then# エラー時の処理# slackとか使ってなかったら、echo "ERROR" でもよい
  ./notify.sh ERROR
else# 成功時の処理# slackとか使ってなかったら、echo "SUCCESS" でもよい
  ./notify.sh SUCCESS
fi

コツ

必要なものはそろっているとして、スクリプトを書き始めてしまって良い。
準備する部分を書き始めると大変なので、それはあとで書けば良いと思う。

とにかく、全部実行できるものがひとつできあがると、いろいろ追加しやすかったという経験があります。